作为一个有社会责任感的企业，安徽丰原马鞍山生物化学有限公司自2000年进入马鞍山起，就秉承“繁衍绿色生命，关爱人类健康”的丰原经营理念，力促经济和环境保护同步和谐发展。建厂之初，就严格依照“三同时”要求，投资3700万元同步建起污水处理系统，日处理污水量达到5000m3，实现达标排放。从2004年起连续获得马鞍山市“绿色企业”称号，并被柠檬酸行业协会评为环保管理“优秀企业”。
       作为环保国控企业，为了保证污水处理系统高效运行，废水稳定达标排放，环保设施自2001年投运以来，公司持续投入资金提高处理能力和效率。其中，投入800多万元，将环保一级厌氧提升为二级厌氧，提升了处理能力，降低了运行成本；投入30多万元引进了5台具有环保专利技术的液下推流器，大大提高了好氧系统效率；投资近200万元实施了曝气沉淀池技术提升。
       在实现污水达标处理的同时，该公司还大力发展以“减量化、再循环、资源化”为基本特征的循环经济，一是将处理后的“污水”一方面用于厂区4万多平方米的绿化灌溉，另一方面将其多余部分用于企业循环水使用,每天节水1300吨左右；二是将厌氧发酵每天产生的13000Nm3沼气进行综合利用，一部分用于企业食堂烹饪，大部分供4吨锅炉和200万大卡直燃式溴化锂制冷机使用，仅此一项，每年就可为企业节约生产成本200多万元。
       与此同时，该公司还不断完善环境管理体系，2003年引入ISO14001:1996环境管理体系以来，通过多次内、外部审核并持续改进，保证了环境体系执行的持续、有效、充分。2009年，公司又开展了清洁生产认证工作，目前此项工作已通过市环保局初审。